Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRAMEF20Q5VT98 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRAMEF20Q5VT98 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PRAMEF20Q5VT98 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PRAMEF20Q5VT98 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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