Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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