Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WASHC2DQ5SRD0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WASHC2DQ5SRD0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms