Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGO1Q5FBB7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGO1Q5FBB7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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