Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms