Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P3H1Q32P28 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms