Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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