Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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