Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CNGA3Q16281 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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