Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC85BQ15834 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms