Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA6Q15825 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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