Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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