Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD3Q15054 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms