Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAPTM4AQ15012 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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