Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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