Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NWD1Q149M9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NWD1Q149M9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NWD1Q149M9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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