Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms