Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL9A3Q14050 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL9A3Q14050 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL9A3Q14050 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL9A3Q14050 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL9A3Q14050 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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