Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL4A6Q14031 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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