Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK13Q14004 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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