Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PWP1Q13610 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PWP1Q13610 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms