Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF6Q13247 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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SRSF6Q13247 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF6Q13247 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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