Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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