Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF1Q13077 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TRAF1Q13077 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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