Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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