Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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