Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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