Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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