Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms