Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNA1Q09470 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms