Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB2Q08289 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms