Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOX4Q06945 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms