Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTDSPL2Q05D32 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms