Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms