Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU5F1Q01860 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms