Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms