Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms