Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARF3P61204 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARF3P61204 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARF3P61204 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms