Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFERP55789 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFERP55789 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFERP55789 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFERP55789 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFERP55789 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFERP55789 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFERP55789 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFERP55789 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms