Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms