Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms