Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5CP41229 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms