Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms