Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF2P35227 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms