Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYKP34925 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms