Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPS1P31327 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPS1P31327 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPS1P31327 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPS1P31327 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPS1P31327 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms