Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms