Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2E2P29084 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms