Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms