Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms